Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN3O95197 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN3O95197 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN3O95197 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN3O95197 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN3O95197 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN3O95197 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN3O95197 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN3O95197 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RTN3O95197 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RTN3O95197 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RTN3O95197 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms