Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHOBTB3O94955 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOBTB3O94955 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOBTB3O94955 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms