Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ECM2O94769 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ECM2O94769 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ECM2O94769 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ECM2O94769 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECM2O94769 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECM2O94769 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECM2O94769 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECM2O94769 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECM2O94769 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms