Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA10O75578 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA10O75578 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms