Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCN2BO60939 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCN2BO60939 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms