Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX2O60749 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX2O60749 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX2O60749 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX2O60749 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX2O60749 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX2O60749 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX2O60749 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX2O60749 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX2O60749 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX2O60749 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX2O60749 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX2O60749 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX2O60749 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX2O60749 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX2O60749 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SNX2O60749 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX2O60749 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX2O60749 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX2O60749 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX2O60749 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX2O60749 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX2O60749 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms