Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLIN3O60664 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PLIN3O60664 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PLIN3O60664 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PLIN3O60664 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN3O60664 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN3O60664 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN3O60664 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN3O60664 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLIN3O60664 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLIN3O60664 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN3O60664 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms