Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMPRSS11DO60235 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMPRSS11DO60235 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms