Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP9O43818 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP9O43818 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP9O43818 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RRP9O43818 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RRP9O43818 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RRP9O43818 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RRP9O43818 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP9O43818 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP9O43818 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP9O43818 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP9O43818 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RRP9O43818 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RRP9O43818 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RRP9O43818 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RRP9O43818 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP9O43818 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP9O43818 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP9O43818 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP9O43818 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RRP9O43818 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RRP9O43818 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms