Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGTAO43765 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGTAO43765 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SGTAO43765 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGTAO43765 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGTAO43765 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SGTAO43765 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGTAO43765 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGTAO43765 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGTAO43765 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGTAO43765 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms