Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRKAB2O43741 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKAB2O43741 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms