Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HTRA2O43464 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTRA2O43464 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTRA2O43464 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms