Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COCHO43405 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COCHO43405 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COCHO43405 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COCHO43405 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COCHO43405 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COCHO43405 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COCHO43405 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COCHO43405 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COCHO43405 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms