Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTIFO43310 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTIFO43310 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTIFO43310 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTIFO43310 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTIFO43310 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTIFO43310 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTIFO43310 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTIFO43310 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTIFO43310 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTIFO43310 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTIFO43310 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTIFO43310 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTIFO43310 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTIFO43310 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTIFO43310 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTIFO43310 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTIFO43310 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTIFO43310 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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