Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KDM6AO15550 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KDM6AO15550 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms