Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCF2LO15068 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCF2LO15068 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms