Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IFIT3O14879 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IFIT3O14879 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms