Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EBAG9O00559 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EBAG9O00559 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EBAG9O00559 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms