Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NFKBIEO00221 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NFKBIEO00221 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIEO00221 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms