Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C0C1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H7C0C1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H7C0C1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H7C0C1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H7C0C1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H7C0C1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H7C0C1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H7C0C1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H7C0C1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H7C0C1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms