Protein–RNA interactions for Protein: F5H6K3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5H6K3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F5H6K3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
F5H6K3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
F5H6K3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
F5H6K3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F5H6K3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
F5H6K3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F5H6K3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F5H6K3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
F5H6K3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F5H6K3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F5H6K3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
F5H6K3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F5H6K3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F5H6K3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
F5H6K3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
F5H6K3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
F5H6K3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
F5H6K3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F5H6K3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms