Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UPK3BL2E5RIL1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UPK3BL2E5RIL1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms