Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MCRIP1C9JLW8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MCRIP1C9JLW8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms