Protein–RNA interactions for Protein: C9IYK1

Gap junction protein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9IYK1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C9IYK1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C9IYK1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C9IYK1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C9IYK1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C9IYK1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C9IYK1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C9IYK1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9IYK1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9IYK1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9IYK1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9IYK1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9IYK1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C9IYK1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9IYK1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9IYK1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9IYK1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9IYK1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C9IYK1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C9IYK1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9IYK1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9IYK1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9IYK1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9IYK1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C9IYK1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms