Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C2CD4DB7Z1M9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms