Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-1B6SEH8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERVV-1B6SEH8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-1B6SEH8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms