Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BECN2A8MW95 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BECN2A8MW95 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms