Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NOTOA8MTQ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms