Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COLCA2A8K830 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COLCA2A8K830 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms