Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF839A8K0R7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF839A8K0R7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF839A8K0R7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms