Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACOD1A6NK06 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACOD1A6NK06 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACOD1A6NK06 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACOD1A6NK06 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms