Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC10BA6NIK2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC10BA6NIK2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms