Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OTOL1A6NHN0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
OTOL1A6NHN0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms