Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM187AA6NFU0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms