Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C5orf60A6NFR6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C5orf60A6NFR6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.2 ms