Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GMNCA6NCL1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GMNCA6NCL1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms