Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRD1A4D1F6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRD1A4D1F6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms