Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms