Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A3GALT2U3KPV4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A3GALT2U3KPV4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
A3GALT2U3KPV4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
A3GALT2U3KPV4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
A3GALT2U3KPV4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A3GALT2U3KPV4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms