Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUBP2Q9Y5Y2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUBP2Q9Y5Y2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUBP2Q9Y5Y2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUBP2Q9Y5Y2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUBP2Q9Y5Y2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms