Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Y9

LSM5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM5Q9Y4Y9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM5Q9Y4Y9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM5Q9Y4Y9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM5Q9Y4Y9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSM5Q9Y4Y9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSM5Q9Y4Y9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LSM5Q9Y4Y9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSM5Q9Y4Y9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSM5Q9Y4Y9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSM5Q9Y4Y9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms