Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP50Q9UKX7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP50Q9UKX7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP50Q9UKX7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP50Q9UKX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NUP50Q9UKX7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP50Q9UKX7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUP50Q9UKX7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP50Q9UKX7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms