Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MGAT4CQ9UBM8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MGAT4CQ9UBM8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MGAT4CQ9UBM8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MGAT4CQ9UBM8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MGAT4CQ9UBM8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MGAT4CQ9UBM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MGAT4CQ9UBM8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms