Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MBD2Q9UBB5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD2Q9UBB5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MBD2Q9UBB5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MBD2Q9UBB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MBD2Q9UBB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD2Q9UBB5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MBD2Q9UBB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD2Q9UBB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms