Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMPD3Q9NY59 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMPD3Q9NY59 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPD3Q9NY59 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPD3Q9NY59 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPD3Q9NY59 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMPD3Q9NY59 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMPD3Q9NY59 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMPD3Q9NY59 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms