Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO4Q9NRQ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO4Q9NRQ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMCO4Q9NRQ5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMCO4Q9NRQ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMCO4Q9NRQ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMCO4Q9NRQ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMCO4Q9NRQ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMCO4Q9NRQ5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMCO4Q9NRQ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMCO4Q9NRQ5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMCO4Q9NRQ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMCO4Q9NRQ5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMCO4Q9NRQ5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms