Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf4Q9NR00 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C8orf4Q9NR00 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf4Q9NR00 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C8orf4Q9NR00 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C8orf4Q9NR00 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C8orf4Q9NR00 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C8orf4Q9NR00 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C8orf4Q9NR00 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C8orf4Q9NR00 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C8orf4Q9NR00 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C8orf4Q9NR00 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms