Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTN4Q9HB63 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NTN4Q9HB63 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NTN4Q9HB63 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NTN4Q9HB63 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NTN4Q9HB63 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTN4Q9HB63 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTN4Q9HB63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTN4Q9HB63 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NTN4Q9HB63 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NTN4Q9HB63 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NTN4Q9HB63 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NTN4Q9HB63 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NTN4Q9HB63 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms