Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACBD3Q9H3P7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACBD3Q9H3P7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACBD3Q9H3P7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACBD3Q9H3P7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACBD3Q9H3P7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACBD3Q9H3P7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACBD3Q9H3P7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACBD3Q9H3P7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACBD3Q9H3P7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACBD3Q9H3P7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ACBD3Q9H3P7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
ACBD3Q9H3P7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ACBD3Q9H3P7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACBD3Q9H3P7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACBD3Q9H3P7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms