Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.785e-9■■■■■ 39.3
FTOQ9C0B1 LRP1-206ENST00000554118 418 ntTSL 28.77□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 39.2
FTOQ9C0B1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.834e-7■■■■■ 38.9
FTOQ9C0B1 BAGE2-201ENST00000470054 1891 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 38.9
FTOQ9C0B1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.723e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-210ENST00000484163 1889 ntTSL 530.74■■■□□ 2.513e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 ODC1-204ENST00000446285 665 ntTSL 530.64■■■□□ 2.53e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 PAXBP1-206ENST00000464256 1692 ntTSL 1 (best)28.61■■■□□ 2.173e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-215ENST00000497953 789 ntTSL 327.46■■□□□ 1.993e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.693e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 PAXBP1-208ENST00000472588 1410 ntTSL 1 (best)25.35■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.563e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.313e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.293e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-212ENST00000487642 770 ntTSL 222.76■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)22.61■■□□□ 1.213e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-203ENST00000463762 726 ntTSL 222.31■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-214ENST00000497436 577 ntTSL 422.09■■□□□ 1.133e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 GLT8D1-205ENST00000464705 622 ntTSL 320.11■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 38.7
FTOQ9C0B1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 38.3
FTOQ9C0B1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 29e-7■■■■■ 38.3
FTOQ9C0B1 C1QTNF12-203ENST00000468365 647 ntTSL 324.26■■□□□ 1.475e-8■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 LRRC41-205ENST00000498402 2068 ntTSL 220.53■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.265e-8■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 TMEM120B-201ENST00000342607 2766 ntTSL 225.8■■□□□ 1.722e-6■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 TMEM120B-207ENST00000541467 2959 ntTSL 514.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 37.8
FTOQ9C0B1 TBC1D5-223ENST00000471679 435 ntTSL 426.18■■□□□ 1.783e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-227ENST00000485432 566 ntTSL 423.36■■□□□ 1.333e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 522.66■■□□□ 1.223e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-221ENST00000452492 581 ntTSL 321.22■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-206ENST00000423331 588 ntTSL 415.63■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-216ENST00000444471 680 ntTSL 315.11■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-226ENST00000481396 609 ntTSL 415.11■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-207ENST00000425944 591 ntTSL 414.55□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-218ENST00000445294 623 ntTSL 214.51□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-204ENST00000414349 687 ntTSL 314.01□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 512.1□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-202ENST00000412981 592 ntTSL 312.1□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-208ENST00000428355 757 ntTSL 311.77□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 311.44□□□□□ -0.583e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 311.22□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 310.91□□□□□ -0.663e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 410.26□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.023e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 47.05□□□□□ -1.283e-8■■■■■ 37.6
FTOQ9C0B1 GPAT4-206ENST00000520258 870 ntTSL 225.15■■□□□ 1.627e-8■■■■■ 37.4
FTOQ9C0B1 GPAT4-208ENST00000521184 572 ntTSL 411.89□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 37.4
FTOQ9C0B1 GPAT4-207ENST00000521121 520 ntTSL 310.92□□□□□ -0.667e-8■■■■■ 37.4
FTOQ9C0B1 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 224.48■■□□□ 1.515e-8■■■■■ 37.3
FTOQ9C0B1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.495e-8■■■■■ 37.3
FTOQ9C0B1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.125e-8■■■■■ 37.3
FTOQ9C0B1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 37.3
FTOQ9C0B1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.637e-7■■■■■ 36.1
FTOQ9C0B1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.537e-7■■■■■ 36.1
FTOQ9C0B1 PTP4A3-205ENST00000523147 558 ntTSL 524.07■■□□□ 1.447e-7■■■■■ 36.1
FTOQ9C0B1 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 322.36■■□□□ 1.177e-7■■■■■ 36
FTOQ9C0B1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 17e-7■■■■■ 36
FTOQ9C0B1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.757e-7■■■■■ 36
FTOQ9C0B1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.697e-7■■■■■ 36
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FTOQ9C0B1 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 514.18□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 36
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FTOQ9C0B1 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 313.01□□□□□ -0.337e-7■■■■■ 36
FTOQ9C0B1 EHMT1-215ENST00000492232 710 ntTSL 312.9□□□□□ -0.347e-7■■■■■ 36
FTOQ9C0B1 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 511.55□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 36
FTOQ9C0B1 ANKRD11-211ENST00000566973 442 ntTSL 224.03■■□□□ 1.447e-8■■■■■ 35.8
FTOQ9C0B1 ANKRD11-215ENST00000568512 294 ntTSL 210.37□□□□□ -0.757e-8■■■■■ 35.8
FTOQ9C0B1 TXNL4A-207ENST00000586825 586 ntTSL 330.67■■■□□ 2.52e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.342e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-205ENST00000586295 706 ntTSL 329.65■■■□□ 2.342e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.162e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-204ENST00000585769 988 ntTSL 224.31■■□□□ 1.482e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-202ENST00000355491 803 ntTSL 1 (best)24.29■■□□□ 1.482e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.32e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.942e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-10■■■■■ 35.7
FTOQ9C0B1 TOM1-216ENST00000492723 2568 ntTSL 219.55■□□□□ 0.725e-8■■■■■ 35.6
FTOQ9C0B1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.761e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 523■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 TOLLIP-211ENST00000530541 684 ntTSL 219.24■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -01e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 312.52□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 510.69□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 UBE2J2-213ENST00000471154 336 ntTSL 53.27□□□□□ -1.891e-7■■■■■ 35.5
FTOQ9C0B1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 C11orf24-207ENST00000532534 687 ntTSL 323.91■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 319.79■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 35.4
FTOQ9C0B1 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.74■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 35.4
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